《脑子是个好东西》系列正式上线

之前写了一篇文章叫《脑子是个好东西》，但是没有写出什么实质性内容，实在是浪费了这个难得的好标题，所以今后把它改成一个系列文章。

两个课题的合并难题

上周比较棘手的事情在于如何构思毕业论文的整体框架，因为众所周知的原因，所有研究生所做的研究内容都是支离破碎的，具体研究什么东西具有很强的随机性， 所以当需要把自己所做的研究整合成一个完整的论文的时候，就会发现每个研究课题的差别都很大，甚至风马牛不相及。但这却又是必须解决的问题。

我目前主要分两个大的方向，一个是莫名其妙的收到了一个实验数据，让我基于此数据进行理论计算，虽然不知道为什么要研究这个东西，但是好歹也是用了好几年时间做了不少工作的。 具体内容就是某个药物作用在一个蛋白上，其实既不知道为什么用的是这个蛋白，也不知道为什么用这个药物，总之就是人家给你什么就得研究什么。 这不禁让我再次感叹这个系列的标题“脑子是个好东西”，可是我到底有没有脑子。

另一个是根据自己的兴趣选择的，因为搞科研如果没有激情还不如不干。那么我的兴趣就在于不断改进并设计一个结构，然后测试它的结果好坏。选择一个酶作为研究对象，背景是生物燃料， 这个背景是去年选定的，放在今年这个油价飞涨的时间节点反倒是非常应景。

那么问题就来了，这两个领域似乎很难找到契合点，除了都是用分子动力学来研究蛋白质功能和结构以外，似乎再无交集了。但是，对于身处在人工智能时代的人来说，这种问题当然要让AI来解决了， 毕竟我也是人工智能的熟练使用者，为此下了不少功夫，也自建了专用隧道专门保障与国际一线AI网站的稳定连接。所以，把这个问题的来龙去脉和现状进展都如实的跟AI描述了一番， 通过几轮沟通交流，突然发现这个问题对AI来说简直是小菜一碟。

AI指导下的统一逻辑

因为自己没有那么高的水平，对生物学背景的了解也相对有限，所以自己是肯定不可能提炼出一个整体思路的，本来想把题目写成拼接的格式， 比如基于分子动力学研究配体对微管蛋白的影响与纤维素内切酶设计，这样写肯定是很傻逼的，主要是因为这压根就没动脑子思考过。

然而AI给出的建议则是建立蛋白功能调控的统一机制，配体药物的作用是外源性修饰，对蛋白质的设计是内源性修饰，都是通过修饰来调控蛋白的功能。 一下子就把两个模块有机的整合到了一起，由于所使用的研究方法是一样的，只是应用在了两个不同蛋白体系中，所以这个论述线索反而非常清晰。比想象中的还要顺利。 具体的细节还没完善好，在这里就不写了。

由此得到的启发

从这个事情上就能看出，只要不是相差太大的两个课题，比如化学和社会学这种，基本都能找出一个共同点，并以此为起点来设计一个论文框架。 没有不合适的课题，只有不会写论文的作者。当然，我的水平很有限，但是并不妨碍我可以使用最强的AI来进行辅助。

后记

这个问题结束了之后，我还跟AI闲聊了几句，就是说好像只要把调控这个因素加入到一个课题中，一下就看起来高端了。其实并不是看起来高端，而是这样确实形成了一个科学研究的流程闭环。 科学研究流程需要发现问题、提出假设、设计验证和得出结论。调控性研究就是提出假设和实验验证的环节，之前对待结构生物学的看法就是总感觉少了点什么东西，现在看来就是调控， 作为下游的结构解析环节是没法做出任何调控的，当然，如果根据得到的结构提出一些突变的方案并重新合成蛋白来验证，那么在更高的维度上也能完成这个科学闭环， 但是目前我自己参与的环节是永远都做不到的，所以我感觉很不对口味，就果断转向了。